Thực phẩm bẩn gây ra nhiều tác hại nghiêm trọng đối với sức khỏe con người. Khi tiêu thụ các loại thực phẩm không an toàn, chứa chất bảo quản độc hại hoặc hóa chất dư lượng, cơ thể có thể bị ngộ độc cấp tính với các biểu hiện như đau bụng, buồn nôn, tiêu chảy, thậm chí đe dọa đến tính mạng nếu không được cấp cứu kịp thời. Bên cạnh đó, những vi khuẩn, virus hay ký sinh trùng tồn tại trong thực phẩm bẩn dễ dàng xâm nhập vào cơ thể, là nguyên nhân dẫn đến các bệnh truyền qua đường tiêu hóa. Đặc biệt, người già, trẻ nhỏ và phụ nữ mang thai là những đối tượng nhạy cảm, rất dễ chịu tác động tiêu cực từ thực phẩm không đảm bảo vệ sinh.

Không chỉ dừng lại ở các ảnh hưởng cấp tính, việc sử dụng thực phẩm bẩn lâu dài còn gây ra các hậu quả nghiêm trọng về mặt sức khỏe cộng đồng. Nhiều loại hóa chất như thuốc trừ sâu, chất tăng trọng, phẩm màu công nghiệp tích tụ trong cơ thể qua thời gian có thể dẫn đến các bệnh mạn tính nguy hiểm, trong đó phổ biến nhất là ung thư, suy gan, suy thận. Ngoài ra, các loại vi khuẩn kháng thuốc trong thực phẩm cũng là nguyên nhân làm gia tăng tình trạng kháng kháng sinh ở người, khiến quá trình điều trị bệnh trở nên khó khăn hơn. Thực phẩm bẩn vì thế không chỉ gây hại cho từng cá nhân mà còn là gánh nặng lớn đối với toàn xã hội về chi phí y tế và sự phát triển giống nòi.