Cục trưởng Cục An toàn thực phẩm là người đứng đầu cơ quan chịu trách nhiệm quản lý nhà nước về an toàn vệ sinh thực phẩm trong phạm vi cả nước. Với vai trò lãnh đạo, cục trưởng đóng vai trò quan trọng trong việc xây dựng và triển khai các chính sách, quy định về kiểm soát chất lượng, nguồn gốc thực phẩm cũng như phòng ngừa các nguy cơ gây hại sức khỏe cộng đồng từ thực phẩm không đảm bảo. Ngoài ra, cục trưởng còn chỉ đạo công tác thanh tra, kiểm tra, xử lý nghiêm các hành vi vi phạm nhằm bảo vệ quyền lợi của người tiêu dùng và nâng cao ý thức cộng đồng về vấn đề an toàn thực phẩm.

Bên cạnh đó, vị trí cục trưởng yêu cầu phải phối hợp chặt chẽ với các bộ, ngành liên quan như Bộ Y tế, Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn, Bộ Công Thương cùng các địa phương nhằm thực hiện hiệu quả các chương trình quốc gia về an toàn thực phẩm. Công tác truyền thông, giáo dục cộng đồng về kiến thức an toàn, phòng chống ngộ độc thực phẩm cũng do Cục trưởng chỉ đạo, định hướng triển khai. Đặc biệt, trong bối cảnh hội nhập quốc tế và sự phát triển mạnh mẽ của thị trường thực phẩm, cục trưởng còn cần cập nhật, áp dụng các tiêu chuẩn quốc tế và mở rộng hợp tác quốc tế để nâng cao chất lượng quản lý tại Việt Nam.

Vai trò của Cục trưởng Cục An toàn thực phẩm không chỉ dừng lại ở việc quản lý, giám sát mà còn thể hiện ở trách nhiệm phản ứng nhanh trước những vụ việc thực phẩm không an toàn, khẩn trương tổ chức điều tra, xác minh, xử lý tận gốc để bảo vệ sức khỏe người dân. Đồng thời, cục trưởng luôn là người tiên phong thúc đẩy đổi mới sáng tạo trong công tác quản lý thực phẩm, không ngừng nâng cao năng lực cán bộ, ứng dụng công nghệ hiện đại phục vụ kiểm nghiệm, truy xuất nguồn gốc, cũng như đề xuất các chính sách phù hợp thực tiễn nhằm từng bước xây dựng nền an toàn thực phẩm bền vững cho đất nước.