Liên Hợp Quốc mặc dù là một tổ chức quốc tế lớn nhất hiện nay, vẫn tồn tại nhiều hạn chế trong hoạt động của mình. Một trong những yếu tố dễ nhận thấy là tính chất không đồng đều về quyền lực giữa các quốc gia thành viên. Cơ chế Hội đồng Bảo an với năm nước thường trực có quyền phủ quyết đã tạo ra sự mất cân bằng trong việc ra quyết định. Những lợi ích quốc gia riêng của các cường quốc đôi khi lấn át mục tiêu chung của Liên Hợp Quốc, dẫn đến tình trạng “tê liệt” trước các vấn đề toàn cầu quan trọng như xung đột vũ trang, vi phạm nhân quyền hay biến đổi khí hậu.

Thêm vào đó, Liên Hợp Quốc thường bị chỉ trích vì hiệu quả hoạt động chưa cao và thiếu khả năng thực thi mạnh mẽ các nghị quyết. Nhiều nghị quyết được thông qua nhưng không có cơ chế cưỡng chế rõ ràng, khiến chúng dễ bị các quốc gia xem nhẹ hoặc phớt lờ. Sự phụ thuộc quá nhiều vào nguồn tài chính và quân lực từ các thành viên giàu có cũng là một hạn chế, làm giảm tính độc lập của tổ chức này trong quá trình giải quyết các khủng hoảng. Các chương trình viện trợ, cứu trợ nhân đạo hay gìn giữ hòa bình nhiều khi gặp khó khăn về kinh phí, nhân lực và thiếu sự phối hợp đồng bộ giữa các bên.

Bên cạnh đó, Liên Hợp Quốc còn gặp phải vấn đề liên quan đến quan liêu và thủ tục hành chính rườm rà. Sự phức tạp trong cấu trúc tổ chức cùng với nền văn hóa đa dạng của các thành viên làm cho việc giải quyết các vấn đề toàn cầu trở nên chậm chạp và thiếu sự linh hoạt cần thiết. Điều này làm giảm sự tin tưởng của cộng đồng quốc tế về sức mạnh thực sự của Liên Hợp Quốc trong vai trò là người điều phối các nỗ lực toàn cầu. Nhiều ý kiến cho rằng, nếu không cải tổ mạnh mẽ về cơ cấu và cách thức hoạt động, Liên Hợp Quốc khó có thể đáp ứng trọn vẹn những thách thức lớn của thế giới hiện đại.