Mè đen là một loại thực phẩm giàu dinh dưỡng và thường được sử dụng trong nhiều món ăn truyền thống. Tuy nhiên, việc tiêu thụ mè đen quá mức có thể gây ra một số tác hại cho sức khỏe. Đầu tiên, mè đen chứa hàm lượng dầu và chất béo cao, nếu ăn quá nhiều sẽ làm tăng nguy cơ béo phì và các bệnh tim mạch do dư thừa năng lượng. Người đang theo chế độ giảm cân hoặc kiểm soát lượng cholesterol cần lưu ý khi bổ sung mè đen vào khẩu phần ăn hằng ngày.

Ngoài ra, mè đen cũng có thể gây dị ứng ở một số người nhạy cảm với thành phần protein trong mè. Các triệu chứng dị ứng phổ biến bao gồm phát ban, ngứa, khó thở hoặc sưng môi, lưỡi. Trường hợp nặng có thể dẫn đến sốc phản vệ đe dọa đến tính mạng. Những người có tiền sử dị ứng với các loại hạt nên hạn chế hoặc tránh sử dụng mè đen để đề phòng những rủi ro không mong muốn đối với sức khỏe cá nhân.

Cuối cùng, tiêu thụ lượng lớn mè đen có thể tạo áp lực lên hệ tiêu hóa, nhất là đối với người mắc các bệnh lý về đường ruột như viêm đại tràng, hội chứng ruột kích thích. Do mè đen rất giàu chất xơ không tan, nếu dùng quá nhiều sẽ dễ gây đầy hơi, chướng bụng hoặc đi ngoài phân lỏng. Vì vậy, để tận dụng tốt giá trị dinh dưỡng của mè đen, mỗi người nên sử dụng với liều lượng vừa phải, phù hợp với nhu cầu và tình trạng sức khỏe của bản thân.