Lịch xả lũ của thủy điện Hòa Bình luôn là vấn đề được người dân khu vực hạ lưu sông Đà, nhất là các tỉnh đồng bằng Bắc Bộ như Hà Nội, Hưng Yên, Hà Nam, đặc biệt quan tâm trong mùa mưa bão. Thông thường, khi có mưa lũ lớn tại lưu vực sông Đà và hệ thống hồ chứa đang vượt ngưỡng cho phép, Ban Chỉ đạo quốc gia về phòng, chống thiên tai sẽ căn cứ vào dự báo khí tượng, thủy văn để ra quyết định về việc xả lũ. Mọi thông tin về lịch xả lũ đều được Công ty Thủy điện Hòa Bình phối hợp cùng chính quyền địa phương thông báo rộng rãi trên các phương tiện thông tin đại chúng trước khi tiến hành xả ít nhất 1 đến 2 ngày, nhằm đảm bảo an toàn tính mạng và tài sản cho nhân dân.

Hoạt động xả lũ chủ yếu diễn ra trong khoảng thời gian từ tháng 6 đến tháng 10, trùng với mùa mưa bão ở miền Bắc. Tuy nhiên, lịch xả cụ thể mỗi năm có thể thay đổi tùy thuộc vào lượng nước về hồ và dự báo thời tiết, thủy văn trong từng thời điểm. Khi cần thiết phải xả lũ, nhà máy thủy điện sẽ thực hiện việc mở dần các cửa xả đáy hoặc tuabin phát điện để điều tiết lưu lượng nước, hạn chế tối đa các tác động tiêu cực đến vùng hạ du. Người dân sống ven sông Đà, đặc biệt ở các huyện như Kỳ Sơn, Kim Bôi (tỉnh Hòa Bình), huyện Ba Vì, thị xã Sơn Tây (Hà Nội) cần chú ý theo dõi sát sao các bản tin dự báo, thông báo từ Ban Chỉ huy phòng chống thiên tai và tìm nơi an toàn nếu cần thiết để phòng tránh rủi ro do nước dâng nhanh bất ngờ.