Ban Chỉ huy Quân sự huyện Tuy An là cơ quan thuộc Bộ Chỉ huy Quân sự tỉnh Phú Yên, chịu trách nhiệm về công tác quốc phòng, quân sự tại địa phương. Đơn vị đóng vai trò quan trọng trong việc tham mưu cho Huyện ủy, UBND huyện về xây dựng nền quốc phòng toàn dân, củng cố thế trận an ninh nhân dân vững chắc. Ngoài ra, Ban Chỉ huy Quân sự huyện còn thực hiện chức năng tổ chức huấn luyện, bồi dưỡng kiến thức về quốc phòng - an ninh cho các cán bộ, chiến sĩ, lực lượng dân quân tự vệ và dự bị động viên. Công tác này nhằm nâng cao ý thức trách nhiệm, trình độ nghiệp vụ, đáp ứng tốt yêu cầu nhiệm vụ bảo vệ Tổ quốc trong tình hình mới.

Bên cạnh nhiệm vụ chuyên môn, Ban Chỉ huy Quân sự huyện Tuy An còn tích cực phối hợp với các cơ quan, đoàn thể địa phương thực hiện các phong trào thi đua yêu nước, hành động vì cộng đồng. Đơn vị thường xuyên tổ chức các hoạt động như phòng chống thiên tai, cứu hộ cứu nạn, giúp dân khắc phục hậu quả mưa bão, xóa đói giảm nghèo, xây dựng nông thôn mới. Những nỗ lực này đã góp phần củng cố mối quan hệ đoàn kết quân dân, xây dựng lòng tin, tạo môi trường ổn định phục vụ phát triển kinh tế - xã hội địa phương. Các chương trình phối hợp luôn nhận được sự hưởng ứng nhiệt tình, đóng góp tích cực từ phía cán bộ, chiến sĩ trong đơn vị.

Luôn phát huy truyền thống anh hùng của lực lượng vũ trang huyện, Ban Chỉ huy Quân sự huyện Tuy An không ngừng đổi mới phương pháp quản lý, chỉ đạo, điều hành. Đơn vị chú trọng nâng cao chất lượng huấn luyện, sẵn sàng chiến đấu, xây dựng đội ngũ cán bộ, chiến sĩ có bản lĩnh chính trị vững vàng, phẩm chất đạo đức tốt, đáp ứng yêu cầu nhiệm vụ trong thời kỳ công nghiệp hóa, hiện đại hóa đất nước. Thông qua các hoạt động thực tiễn, Ban Chỉ huy Quân sự huyện đã khẳng định được vị trí quan trọng trong sự nghiệp xây dựng và bảo vệ quê hương Tuy An nói riêng, góp phần giữ gìn ổn định an ninh quốc phòng khu vực nói chung.