Suy giảm đa dạng sinh học kéo theo hàng loạt hậu quả nghiêm trọng đối với môi trường và con người. Khi các loài vật, thực vật và vi sinh vật biến mất hoặc số lượng giảm mạnh, các hệ sinh thái mất cân bằng và chức năng tự nhiên bị suy yếu. Điều này ảnh hưởng trực tiếp đến dịch vụ hệ sinh thái như điều hòa khí hậu, lọc nước, thụ phấn cây trồng hoặc kiểm soát sâu bệnh. Hậu quả là sản lượng nông nghiệp có thể giảm, rủi ro về thiên tai như lũ lụt và hạn hán gia tăng, làm tổn hại đời sống và sinh kế của hàng triệu người, nhất là cộng đồng phụ thuộc nhiều vào nguồn tài nguyên thiên nhiên.

Ngoài tác động lên môi trường, suy giảm đa dạng sinh học còn ảnh hưởng sâu sắc đến lĩnh vực y tế và văn hóa. Nhiều loại thuốc quý được chiết xuất từ động thực vật hoang dã đứng trước nguy cơ biến mất, hạn chế tiềm năng phát triển thuốc mới để chữa các bệnh hiểm nghèo. Mặt khác, các giá trị văn hóa truyền thống gắn với các loài đặc hữu cũng mai một dần, đe dọa bản sắc cộng đồng. Về lâu dài, mất đa dạng sinh học làm giảm khả năng thích ứng của sinh giới đối với biến đổi khí hậu, khiến những thách thức môi trường ngày càng trở nên phức tạp và khó kiểm soát.