Gạo lứt là loại thực phẩm giàu dinh dưỡng, tuy nhiên cũng có một số sự kỵ nhất định cần lưu ý để đảm bảo an toàn sức khỏe và không làm giảm hiệu quả hấp thu dinh dưỡng. Trước hết, gạo lứt không nên dùng cùng với các loại thực phẩm quá nhiều chất xơ hoặc thực phẩm khó tiêu như rau sống, củ cứng sống (cà rốt sống, khoai lang sống). Do hàm lượng chất xơ trong gạo lứt vốn đã cao hơn gạo trắng rất nhiều, nếu kết hợp thêm những thực phẩm quá nhiều xơ hoặc khó tiêu sẽ dễ gây ra đầy bụng, khó tiêu và thậm chí ảnh hưởng đến khả năng hấp thu các chất dinh dưỡng khác như vitamin hoặc khoáng chất.

Một điểm nữa là gạo lứt đặc biệt không phù hợp khi dùng chung với thực phẩm giàu axit oxalic như rau muống, rau bina, cải bó xôi hoặc các loại thực phẩm chứa canxi liều cao. Axit oxalic và chất xơ từ gạo lứt có thể kết hợp với nhau, tạo thành các hợp chất khó tan khiến cơ thể khó hấp thu canxi, sắt và nhiều khoáng chất khác, dễ dẫn đến tình trạng thiếu chất hoặc rối loạn chuyển hóa. Đặc biệt ở người lớn tuổi hoặc trẻ em, việc ăn gạo lứt kết hợp với các thực phẩm kể trên kéo dài có thể gây tình trạng suy dinh dưỡng tiềm tàng hoặc thiếu vi chất quan trọng cho cơ thể.

Cuối cùng, gạo lứt không nên chế biến cùng các món chiên nhiều dầu mỡ hoặc thịt đỏ nhiều chất béo. Thành phần chất xơ trong gạo lứt sẽ dễ hút dầu mỡ, khiến món ăn trở nên khó tiêu, gây đầy bụng và tăng nguy cơ mắc bệnh đường tiêu hóa. Ngoài ra, việc ăn gạo lứt chiên ngập dầu còn làm mất đi lợi ích giảm cân, tốt cho tim mạch của loại thực phẩm này. Người ăn nên chế biến gạo lứt bằng cách nấu, hấp hoặc trộn salad nhẹ nhàng để giữ nguyên được hàm lượng dinh dưỡng tốt nhất mà không gây phản ứng bất lợi cho sức khỏe.