Năm 2021, Học viện Khoa học Quân sự là một trong những trường quân đội có mức điểm chuẩn khá cao tại Việt Nam. Đối với thí sinh dự thi vào hệ đại học chính quy thuộc các khối ngành như ngoại ngữ, an ninh quốc phòng, mức điểm chuẩn dao động từ 22 điểm đến 28 điểm tùy từng ngành và đối tượng tuyển sinh. Riêng khối ngành Ngôn ngữ Anh và Ngôn ngữ Nga luôn nằm trong top các ngành lấy điểm đầu vào cao nhất, có những tổ hợp xét tuyển mà thí sinh phải đạt trên 27 điểm mới đủ điều kiện trúng tuyển. Đặc biệt, các ngành đặc thù dành cho nữ giới thường lấy số lượng ít và đòi hỏi mức điểm chuẩn thậm chí cao hơn so với nam giới.

Ngoài tiêu chí về điểm thi tốt nghiệp THPT, Học viện Khoa học Quân sự còn áp dụng nhiều yêu cầu bổ sung như kiểm tra sức khỏe, lý lịch chính trị, phẩm chất đạo đức đối với tất cả các thí sinh đăng ký xét tuyển. Do đó, dù có mức điểm thi cao nhưng nếu không đáp ứng các tiêu chí của ngành quân sự thì thí sinh vẫn có thể bị loại. Điều này khiến quá trình tuyển sinh của trường trở nên đặc biệt nghiêm ngặt, đòi hỏi thí sinh không chỉ giỏi về học lực mà còn phải hội tụ đầy đủ các yếu tố thể chất, tinh thần và bản lĩnh chính trị phù hợp với môi trường quân đội.

Việc Học viện Khoa học Quân sự giữ mức điểm chuẩn cao qua các năm phản ánh vị trí quan trọng của trường trong hệ thống đào tạo nhân lực chất lượng cao cho quân đội và nhà nước. Sinh viên tốt nghiệp từ học viện hầu hết đều đảm nhiệm các vị trí chiến lược tại các đơn vị quân đội, cơ quan nghiên cứu hoặc các tổ chức đối ngoại. Điều này cũng góp phần lý giải vì sao mỗi mùa tuyển sinh, số lượng thí sinh đăng ký vào Học viện Khoa học Quân sự luôn rất lớn, mặc dù tỉ lệ trúng tuyển lại khá thấp, là động lực để các bạn thí sinh nỗ lực nhiều hơn nếu muốn trở thành học viên của trường này.