Cơ cấu tổ chức Công an tỉnh Nam Định được xây dựng dựa trên nguyên tắc tập trung, thống nhất, phù hợp với quy mô, đặc điểm tình hình của địa phương. Đứng đầu là Giám đốc Công an tỉnh, chịu trách nhiệm lãnh đạo, chỉ đạo công tác đảm bảo an ninh trật tự, phòng chống tội phạm trên toàn địa bàn tỉnh Nam Định. Dưới quyền Giám đốc là các Phó Giám đốc phụ trách từng lĩnh vực, mỗi người quản lý một hoặc một số phòng nghiệp vụ chuyên môn, đảm bảo hiệu quả trong công tác chỉ đạo thực hiện các nhiệm vụ trọng tâm.

Bên cạnh Ban Giám đốc, hệ thống các phòng chức năng trực thuộc Công an tỉnh Nam Định bao gồm nhiều đơn vị chuyên trách như: Phòng An ninh nội địa, Phòng Cảnh sát hình sự, Phòng Cảnh sát giao thông, Phòng Cảnh sát phòng cháy chữa cháy và cứu nạn cứu hộ, Phòng Quản lý hành chính về trật tự xã hội, Phòng Tổ chức cán bộ... Mỗi phòng có nhiệm vụ chuyên môn riêng và phối hợp chặt chẽ cùng các đơn vị bạn để giải quyết các vấn đề về an ninh, trật tự và xây dựng lực lượng. Ngoài ra, Công an tỉnh còn có các đơn vị tham mưu, hỗ trợ về công tác hậu cần, kỹ thuật, tài chính, tạo nền tảng giúp lực lượng hoàn thành tốt mục tiêu bảo vệ an ninh quốc gia, giữ gìn trật tự an toàn xã hội tại địa phương.

Dưới cấp phòng, hệ thống Công an các huyện, thành phố và thị xã đóng vai trò trực tiếp triển khai các nhiệm vụ tại cơ sở. Các đơn vị này phối hợp chặt chẽ với chính quyền địa phương và lực lượng quần chúng nhân dân để thực hiện công tác phòng ngừa, đấu tranh chống tội phạm, giải quyết kịp thời các tình huống phát sinh. Cơ cấu hoạt động của Công an tỉnh Nam Định vừa bảo đảm tính chuyên nghiệp, vừa đáp ứng được yêu cầu, tình hình thực tế tại từng địa phương, góp phần tích cực vào việc xây dựng môi trường an toàn, ổn định cho phát triển kinh tế - xã hội của tỉnh.