Ấu trùng ruồi là giai đoạn non của các loài ruồi thuộc bộ Hai cánh, xuất hiện ngay sau quá trình trứng nở. Hầu hết các ấu trùng này có thân mềm, không chân, hình dạng thon dài như con sâu và màu sắc thường là trắng hoặc hơi vàng nhạt. Ấu trùng ruồi phát triển rất nhanh trong môi trường giàu chất dinh dưỡng, đặc biệt là các chất hữu cơ phân hủy như rác thải, xác động vật hoặc thực phẩm mục rã. Chúng tiêu hóa và hấp thụ thức ăn bằng cách tiết ra enzym, đồng thời góp phần tích cực vào việc phân hủy và tái chế vật chất hữu cơ trong tự nhiên. Một số loài ấu trùng có vai trò quan trọng trong nông nghiệp và xử lý rác thải vì khả năng chuyển hóa rác thành các sản phẩm có ích, ví dụ như phân compost hoặc protein phục vụ chăn nuôi.

Tuy vậy, sự xuất hiện của ấu trùng ruồi cũng tiềm ẩn một số nguy cơ đối với sức khỏe con người và động vật. Khi hiện diện ở những nơi không đảm bảo vệ sinh, ấu trùng ruồi có thể là nguồn lây truyền vi khuẩn, gây ô nhiễm thức ăn, nước uống và làm phát sinh các bệnh như nhiễm khuẩn đường ruột, ngộ độc thực phẩm. Đặc biệt, một số loài như ruồi nhà hay ruồi giấm nếu để trứng ở trên thực phẩm sẽ rất nguy hiểm nếu con người vô ý ăn phải. Ngoài ra, các loại ruồi ký sinh như ruồi nhặng còn có thể gây ra bệnh giòi bò ở người và động vật, khiến tổ chức cơ thể bị tổn thương và gia tăng nguy cơ bội nhiễm. Điều này đòi hỏi con người cần chú ý giữ gìn vệ sinh môi trường, bảo quản thực phẩm cẩn trọng để hạn chế tác hại của ấu trùng ruồi.

Bên cạnh mặt tiêu cực, nhiều nghiên cứu gần đây đã tận dụng những lợi ích của ấu trùng ruồi trong các lĩnh vực sản xuất sạch và phát triển bền vững. Ví dụ, ấu trùng ruồi lính đen được sử dụng để xử lý rác hữu cơ, vừa giúp giảm lượng chất thải lại vừa tạo ra nguồn thức ăn giá trị cho gia súc, gia cầm, cá hay thậm chí dùng trong công nghiệp dược phẩm và mỹ phẩm. Ấu trùng ruồi cũng có khả năng sản xuất các hợp chất kháng khuẩn tự nhiên, mở ra tiềm năng ứng dụng trong y dược. Nhờ vào những ưu điểm này, khoa học hiện đại đang ngày càng quan tâm đến việc khai thác hiệu quả các đặc tính nổi bật của giai đoạn ấu trùng ruồi nhằm phục vụ nhu cầu phát triển kinh tế gắn với bảo vệ môi trường.