Bộ máy của Bộ Công an Việt Nam được tổ chức theo một hệ thống chặt chẽ từ trung ương tới địa phương, nhằm bảo đảm thực hiện nhiệm vụ giữ gìn an ninh quốc gia, trật tự, an toàn xã hội và bảo vệ lợi ích của Nhà nước, quyền, lợi ích hợp pháp của tổ chức, cá nhân. Đứng đầu Bộ Công an là Bộ trưởng, dưới quyền là các Thứ trưởng, phụ trách nhiều lĩnh vực công tác khác nhau. Cơ cấu tổ chức của Bộ bao gồm các Cục, Vụ, Văn phòng và các đơn vị sự nghiệp trực thuộc, mỗi đơn vị đảm nhiệm các chức năng chuyên môn về quản lý nhà nước trong lĩnh vực an ninh, trật tự, phòng chống tội phạm hoặc tham mưu, hỗ trợ cho lãnh đạo Bộ.

Ở cấp tỉnh và thành phố trực thuộc trung ương, lực lượng công an được tổ chức thành Công an tỉnh (hoặc thành phố), đứng đầu là Giám đốc Công an. Tại mỗi huyện, quận, thị xã, thành phố thuộc tỉnh tổ chức Công an huyện do Trưởng công an huyện điều hành; ở cấp xã, phường, thị trấn có Công an xã hoặc phường, chịu trách nhiệm trực tiếp đảm bảo an ninh trật tự tại địa bàn. Hệ thống tổ chức này còn có các lực lượng chuyên trách như Cảnh sát giao thông, Cảnh sát phòng cháy chữa cháy, An ninh, Cảnh sát hình sự, Quản lý hành chính về trật tự xã hội, v.v., tạo nên một mạng lưới rộng khắp, phối hợp, hỗ trợ lẫn nhau trong thực hiện nhiệm vụ chung.

Ngoài ra, Bộ Công an còn có các cơ sở đào tạo như Học viện An ninh nhân dân, Học viện Cảnh sát nhân dân và nhiều trường đào tạo, bồi dưỡng cán bộ khác. Đây là nơi rèn luyện, đào tạo nguồn nhân lực chất lượng cao cho lực lượng Công an nhân dân Việt Nam. Như vậy, bộ máy tổ chức của Bộ Công an vừa mang tính tập trung thống nhất, vừa mở rộng tới từng địa phương, từng ngành nghề chuyên môn, bảo đảm công tác chỉ đạo, điều hành linh hoạt, kịp thời, đáp ứng yêu cầu, nhiệm vụ giữ gìn an ninh quốc gia và trật tự, an toàn xã hội trong tình hình mới.