Bộ máy nhà nước Liên bang Nga được tổ chức theo nguyên tắc phân quyền và kết hợp giữa yếu tố tổng thống mạnh với hệ thống nghị viện, tạo nên một cấu trúc nhà nước liên bang đặc thù. Tại trung ương, quyền lực tối cao thuộc về Tổng thống Liên bang Nga, người vừa là nguyên thủ quốc gia, vừa là Tổng tư lệnh các lực lượng vũ trang. Tổng thống có quyền bổ nhiệm Thủ tướng, chủ trì Hội đồng An ninh, trực tiếp chỉ đạo các vấn đề đối nội và đối ngoại quan trọng, cũng như ban hành sắc lệnh có giá trị pháp lý tương đương luật trong nhiều lĩnh vực. Tuy vậy, quyền lực của Tổng thống vẫn chịu sự giám sát và cân bằng từ phía Quốc hội Liên bang (Federal Assembly), bao gồm hai viện: Hội đồng Liên bang (Thượng viện) và Duma Quốc gia (Hạ viện), đảm nhiệm vai trò lập pháp và kiểm soát các hoạt động của chính phủ.

Ngoài ra, cơ cấu tổ chức chính quyền tại Nga còn bao gồm Chính phủ Liên bang do Thủ tướng đứng đầu, chịu trách nhiệm tổ chức thực hiện các chính sách kinh tế, xã hội của đất nước dựa trên nghị quyết của Tổng thống và Quốc hội. Các bộ, ngành trung ương, các cơ quan dưới quyền Chính phủ chịu trách nhiệm quản lý, điều hành các lĩnh vực chuyên môn về kinh tế, tài chính, quốc phòng, an ninh, văn hóa, giáo dục,... Hệ thống tư pháp Nga tách bạch với hành pháp, gồm các tòa án như Tòa án Hiến pháp, Tòa án Tối cao, Tòa án Trọng tài tối cao, đóng vai trò giải thích và bảo vệ Hiến pháp cũng như xét xử các vụ tranh chấp lớn. Sự đa tầng này bảo đảm quyền lực không bị tập trung quá mức vào một thể chế duy nhất và thúc đẩy sự kiểm soát, cân bằng trong toàn bộ hệ thống chính trị.

Đặc biệt, với tính chất là một quốc gia liên bang đa thành phần, bộ máy nhà nước Nga còn tổ chức chính quyền địa phương ở 83 thực thể liên bang gồm các nước cộng hòa, vùng lãnh thổ, tỉnh thành phố có quyền tự trị nhất định. Mỗi đơn vị này có hiến pháp hoặc điều lệ riêng, song vẫn tuân thủ Hiến pháp Liên bang và chịu sự giám sát của Trung ương. Hệ thống này góp phần phản ánh sự đa dạng về dân tộc, truyền thống, văn hóa của Nga, đồng thời giúp phân bổ quyền lực hợp lý giữa Trung ương và địa phương, giữ vững ổn định chính trị cũng như phát triển kinh tế - xã hội toàn diện trên cả nước.